AJ Auxerre, Fransa'nın Bourgogne bölgesine bağlı Auxerre kentinin futbol takımı olarak 1905 yılında kuruldu. Mavi ve beyaz renklerin hakim olduğu formalarıyla tanınan kulüp, iç saha maçlarını 23.467 kişilik Stade de l'Abbé-Deschamps stadyumunda oynuyor. Takım, mavi melekler lakabıyla da biliniyor.
Kulübün kaderini uzun yıllar boyunca şekillendiren isim ise Guy Roux oldu. Roux, 1961 yılından 2005'e kadar süren teknik direktörlük kariyerinde Auxerre'i en alt ligden alıp 1980 yılında Ligue 1'e yükseltti. 1996'da ise takımının Ligue 1 şampiyonluğunu kazanmasını sağladı, bu da onun kırılması güç bir rekora imza atmasını sağladı.
Fransız sinemasına da ilham veren Auxerre, Jean-Jacques Annaud'un 1978 yapımı "Coup de tête" adlı filminde de yer aldı. Film, Auxerre-Troyes maçından alınan görüntüler ve takımın hikayesini işlemesiyle dikkat çekiyor.
Fransa Kupası'nda dört kez şampiyonluğa ulaşan Auxerre, 1994, 1996, 2003 ve 2005 yıllarında bu başarıya imza attı. 1997 yılında Intertoto Kupası'nı da kazanan takım, 1980 yılında Ligue 2 şampiyonluğunu ve 2024'te tekrar bu başarıya ulaşırken, 1996 yılında da Ligue 1 şampiyonluğunu kazandı. 2021-2022 sezonunda play off şampiyonluğu yaşadı.
