Augsburg’un mavi-beyazlı takımı, 1907 yılında Fußball-Klub Alemannia Augsburg adıyla kuruldu ve Bavyera’nın bu tarihi kentinin ilk futbol kulüplerinden biri olarak adını duyurmaya başladı. Kuruluşunun ardından uzun yıllar yerel liglerde boy gösteren ekip, 1921’de adını BC Augsburg olarak değiştirerek mücadelesine devam ettiyse de, yaşadığı sportif zorluklar nedeniyle 1969 yılında bölgenin diğer bir takımı olan TSV Schwaben Augsburg ile birleşmek zorunda kaldı. Bu birleşme sonucu bugünkü ismiyle yoluna devam eden kulüp, o dönemdeki dördüncü ligde kalmayı başardı.
Yıllar içinde performansını artıran takım, 2006-07 sezonundan itibaren Almanya’nın ikinci ligi olan 2. Bundesliga’da yer almaya başladı. 2010-11 sezonu sonunda ise tarihinin en önemli başarısını elde ederek ilk kez Bundesliga’ya yükselmeyi başardı. O günden bu yana bu en üst düzey ligde mücadele eden Augsburg, hem yerel hem de ulusal arenada adından söz ettirmeye devam ediyor.
Kulübün tarihindeki en önemli başarılarından biri de Schwaben Kupası’ndaki üstün performansı oldu. 1969’dan itibaren birçok kez bu kupada şampiyonluğa ulaşan ekip, 1980, 1986, 1988, 1993, 1996, 1999, 2002, 2004 ve 2005 yıllarında da kupanın sahibi oldu. Bu başarılar, takımın hem yerel arenadaki hem de ulusal düzeydeki istikrarlı performansının bir göstergesi olarak kabul ediliyor.
