Türk Silahlı Kuvvetleri Genelkurmay Başkanlığı, Türkiye'nin silahlı kuvvetlerini yöneten en yüksek askeri organdır. Anayasa kapsamında Genelkurmay Başkanı, Silahlı Kuvvetlerin komutanı olarak Cumhurbaşkanı tarafından atanır ve savaş hâlinde Cumhurbaşkanlığı adına başkomutanlık görevini yürütür. Bu makam, Millî Savunma Bakanlığına bağlı olarak çalışır.
Kuruluşun temel görevleri arasında, savaş zamanında Cumhurbaşkanının temsilcisi olarak başkomutanlık yapmanın yanı sıra, Silahlı Kuvvetlerin savaş hazırlıklarını planlamak yer alır. Bu kapsamda personel, istihbarat, harekât, teşkilat ve eğitim hizmetlerine ilişkin ilke, öncelik ve ana programlar hazırlanır, Millî Savunma Bakanının onayına sunulur.
Ayrıca, uluslararası anlaşma ve antlaşmaların askeri boyutlarıyla ilgili görüş ve önerilerde bulunur, gerektiğinde bu toplantılara katılır ya da temsilci gönderir. Görev ve yetkileri çerçevesinde, ilgili bakanlıklar, daireler ve kurumlarla doğrudan yazışma ve temas kurma yetkisi de kendisine tanınmıştır.
Genelkurmay karargâhındaki J başkanlıkları, Genelkurmay II. Başkanına bağlı olarak faaliyet gösteren ve korgeneral ya da koramiral rütbesindeki komutanlardan oluşan bir “beyin takımı” olarak kabul edilir. Bu birimler, Türk Silahlı Kuvvetlerinin en kritik karargâh görevlerini yerine getirir. Cumhurbaşkanlığı Teşkilatı Hakkında Kararname’ye göre, Genelkurmay Başkanı ile Kara, Deniz ve Hava Kuvvetleri Komutanları, Millî Savunma Bakanına ayrı ayrı rapor verir ve sorumluluk taşır.
