Varto keçi peyniri, Muş'un Varto ilçesinde yapılan geleneksel bir keçi sütü peyniridir. Adından anlaşılacağı gibi yörenin keçi yetiştiriciliği geleneğine dayanır.
Geleneksel üretiminde süt, ocakta değil güneş sıcaklığında ılıtılır. Bu yöntem sütü aşırı ısıtmadan mayalama sıcaklığına getirir; yüksek ısı süt proteinlerini bozarak peynirin verimini ve dokusunu olumsuz etkiler. Modern koşullarda aynı sonuca kontrollü ısıtmayla ulaşılır.
Keçi sütü, inek sütüne göre daha küçük yağ globülleri ve farklı kazein yapısı içerir. Bu, pıhtının daha yumuşak olmasına yol açar; kesme ve süzme işlemleri nazik yapılmalıdır. Sert davranıldığında teleme parçalanır ve verim düşer. Buna karşılık keçi peyniri daha kolay sindirilir ve karakteristik keskin aromasıyla tanınır.